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L3 BMCP Bioch Statistiques pour la Biologie : Plan du cours

L3 BMCP Bioch
 
Statistiques pour la Biologie
Fiches de soutien au cours

 

 

 

 

 TD Unique à préparer


Cours 1 - Jeudi 8 septembre

Présentation de l'UE, objectifs, contenu, fonctionnement, examens

 

Partie 1 - Méthodologie

     1.1 Place des statistiques dans une recherche scientifique

     Montrer la nécessité des statistiques dans la recherche et leur utilité hors recherche; montrer qu'il est nécessaire de penser "statistiques" dès la conception de l'expérience

              - Départ en voyage
              - Déroulement d'une recherche
              - A quelles étapes les statistiques sont-elles utiles ?
     1.2 Expérimentation et enquête

      Sensibiliser aux points forts et faibles respectifs de l'expérimentation et de l'enquête

     1.3 Typologie des variables en fonction de la quantité d'information véhiculée

     En plus de présenter les différents types de variables, cette partie permet de montrer l'importance de concevoir son expérimentation en pensant aux statistiques
     1.4 Statut des variables dans l'expérimentation et dans l'enquête
           Intérêt de cette typologie et de la connaissance des statuts

         Le choix des variables indépendante et dépendante dépend de la question posée

 

Partie 2 - Méthodologie

2.1 Les facteurs et le contrôle de leurs effets

       Opérationnalisation des variables indépendantes en facteurs

       Variables dont il faut contrôler l'effet

 

Cours 2 - Mercredi 14 septembre (J. Poix) : Tests non paramétriques, X², Kolmogorov-Smirnov

 

Cours 3 - Mardi 20 septembre (J. Poix) : Tests non paramétriques, X², Kolmogorov-Smirnov

 

Cours 4 - Mercredi 28 septembre (P. Magal) : Statistiques descriptives, régression, probabilités

 

Cours 5 - Mardi 18 octobre (P. Magal) : Statistiques descriptives, régression, probabilités

 

 

Cours 6 - Jeudi 3 novembre

2.2 De l'hypothèse théorique à l'hypothèse statistique

     Cette partie permet de former à la démarche scientifique et d'introduire les concepts d'hypothèses forte et faible qui se traduiront par les hypothèses uni-et bi-latérales

       Hypothèses, hypothèses fortes, hypothèses faibles
       Les types d'hypothèses lors d'une recherche

2.3 La logique des tests statistiques

    Tester l'hypothèse H0 qui est contraire à l'hypothèse théorique afin de savoir si H0 doit être rejetée. Hypothèse nulle et hypothèse alternative

 

Partie 3 - Le t de Student

3.1 Introduction au t de Student : calcul de la moyenne et de la variance, explication du t

   La question que l'on se pose
   Approche intuitive du t de Student
                  - Moyenne d'un échantillon et moyenne d'une population
           Estimation de la variabilité

                  - Un indice de variabilité intuitif mais non utilisé : la moyenne des écarts à la moyenne
                  -
La variance

                  - L'écart type

                  - Variance de la population

                  - Ecart type de la population

           Un trait de lumière sur le t de Student

3.2 Conditions d'utilisation; correction de Welch     
3.3 Tests uni- et bilatéraux

3.4 Rédaction de résultats suite à un t de Student

                  - Les données du problème
                  - Cas des calculs faits par un logiciel

 

 

Cours 7 - Mardi 15 novembre

3.5 Echantillons indépendants et appariés

            Le t de Student pour échantillons appariés 

 

Partie 4 - L'analyse de variance à 1 facteur

         4.1 Intérêt et principe de l'analyse de variance à 1 facteur

         4.2 Comparaison ANOVA vs Student

                   - Avantages et inconvénients respectifs

                   - Comparaison des résultats

         4.3 Déroulement d'une ANOVA à 1 facteur     

         4.4 Les tests post-hoc

         4.5 Analyse et rédaction des résultats d'une ANOVA à 1 facteur
             - Exemple

 

TD 3 (P. Magal)

 

Cours 8 - Lundi 21 novembre

Partie 5 - L'analyse de variance à 2 facteurs; ANOVA en mesures répétées

          5.1 Hypothèse d'interaction statistique

              Notion d'interaction statistique entre deux variables

          5.2 Les étapes d'une ANOVA à 2 facteurs
          5.3 Interprétation et rédaction de résultats d'une ANOVA à 2 facteurs

            - ANOVA à 2 facteurs : exemple
            -
Différentes formes de résultats (significations des FPS1, FPS2 et interaction)

          5.4 ANOVA en mesures répétées

             - ANOVA à 2 facteurs dont 1 en mesures répétées : exemple

          5.5 Analyse de la variance

          5.6 ANOVA à 3 facteurs

Pdf n°1 du cours (ANOVA à 2 facteurs)

Pdf n°2 du cours (ANOVAs à 2 et 3 facteurs)

 

TD 4 (P. Magal)

 

Cours 9 - Lundi 28 novembre

pdf utilisé en cours : Corrélation, MANOVA, ANCOVA, Choix de test

pdf utilisé en cours : ANOVA à 2 facteurs (interaction)

 

Partie 6 - Combinaisons d'ANOVAs et de corrélations

         6.1 Rappels sur la corrélation et la régression
         6.2 MANOVA
         6.3 ANCOVA

 

Partie 7 - Choisir son test statistique

          Clé 1 Student

          Clé 2 ANOVA à 1 facteur

          Clé 3 Tests non paramétriques

 

 

TD Unique à préparer

 

TD1 Student (X. Noguès) : Préparer leexercices 1, 2 et 4 du TD Student (mis en ligne le 8 septembre 2015)

=> Corrigé TD1 Student (NB:  Il s'agit du bon corrigé, même si c'est marqué TD 4 en première page !)

 

      - TD5 ANOVA (X. Noguès : cf instructions sur le pdf).

=> Corrigé TD5 ANOVA

  

 

Corrigé exam 1ère session

 



17/11/2014
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