ANOVA 1 facteur : exemple d'analyse
On compare les tailles de plantes (en centimètres) mesurées sur 6 stations différentes caractérisées par leur altitude (en mètres). On effectue une analyse de variance à 1 facteur. Les résultats de l'analyse sont les suivants :
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Categorical values encountered during processing are:
ALTITUDE$ (6 levels) : 0000, 0500, 1000, 1500, 2000, 2500
Dep Var: TAILLE N: 72 Multiple R: 0.497 Squared multiple R: 0.247
Analysis of Variance
Source Sum-of-Squares df Mean-Square F-ratio P
ALTITUDE$ 13.493 5 2.699 4.339 0.002
Error 41.050 66 0.622
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Least squares means.
LS Mean SE N
ALTITUDE$ = 0000 4.533 0.228 12
ALTITUDE$ = 0500 4.806 0.228 12
ALTITUDE$ = 1000 5.172 0.228 12
ALTITUDE$ = 1500 5.554 0.228 12
ALTITUDE$ = 2000 5.536 0.228 12
ALTITUDE$ = 2500 4.504 0.228 12
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Durbin-Watson D Statistic 2.188
First Order Autocorrelation -0.108
ROW ALTITUDE$
1 0000
2 0500
3 1000
4 1500
5 2000
6 2500
Using least squares means.
Post Hoc test of TAILLE
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Using model MSE of 0.622 with 66 df.
Matrix of pairwise mean differences:
1 2 3 4 5 6
1 0.000
2 0.273 0.000
3 0.639 0.366 0.000
4 1.021 0.748 0.382 0.000
5 1.004 0.731 0.364 -0.018 0.000
6 -0.029 -0.302 -0.668 -1.050 -1.032 0.000
Tukey HSD Multiple Comparisons.
Matrix of pairwise comparison probabilities:
1 2 3 4 5 6
1 1.000
2 0.957 1.000
3 0.362 0.864 1.000
4 0.027 0.199 0.842 1.000
5 0.031 0.221 0.867 1.000 1.000
6 1.000 0.935 0.313 0.021 0.024 1.000
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Interprétation :
L'analyse de variance montre que le facteur altitude a un effet significatif sur le développement des plantes (p=0,002; F=4,34; ddl1=5;ddl2=66). Plus précisément, entre l'altitude 0 et l'altitude 1500m, la taille des plantes augmente. Les analyses a posteriori avec un test de Tukey montent une différence significative (à 5%) des tailles entre les zones situées à 0 m d'altitude d'une part, et à 1500 et 2000 m d'altitude d'autre part. A partir de 1500 m, la taille des plantes diminue (les plantes situées à 1500 et 2000 m sont significativement plus grandes que celles situées à 2500 m (p<0.05 dans les deux cas). En conclusion, l'altitude optimale pour le développement de cette plante se situe à environ 1500 à 2000 m.
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