Etapes d'une ANOVA à 2 facteurs
Une ANOVA à 2 facteurs donnera :
- 1 résultat pour l'interaction entre les deux facteurs
- 1 résultat pour le FPS1
- 1 résultat pour le FPS2
Si l'on a effectué une ANOVA à 2 facteurs, c'est que l'on avait une hypothèse au sujet de l'interaction entre ces deux facteurs.
On commence donc par regarder la p-value de l'interaction.
- Si l'interaction n'est pas significative, on se dirige vers les effets globaux des deux facteurs pris indépendamment.
- Si elle est significative, on peut effectuer une ANOVA à 1 facteur sur chaque modalité d'un des facteurs (ou un t de Student si ce facteur n'a que deux modalités). Puisque une interaction signifie que l'effet d'un facteur n'est pas le même aux modalités de l'autre facteur, cela permet d'analyser l'effet du premier facteur modalité par modalité du second facteur et ainsi de voir en quoi cet effet n'est pas le même. On peut ensuite regarder les effets globaux de chaque facteur pris indépendamment, mais il faut alors, connaissant le sujet, savoir si cela a du sens : un effet global "statistiquement" significatif n'est pas forcément "biologiquement" significatif.
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